古老村落中有一座废弃的蛇窟，传说里面藏着能治愈百病的神药。为救重病的妹妹，少年阿九不顾禁忌闯入蛇窟。石窟内机关重重，更有巨蛇守护。在绝境中，阿九意外唤醒了一位沉睡的古代蛇灵少女，她答应帮助他，但代价是要解开自己被封印的真相。两人在蛇窟深处冒险，逐渐发现神药背后隐藏着更深的阴谋。
阿九在月圆之夜割破手指，用血打开蛇窟石门，听到里面传出低沉的蛇鸣。
蛇窟内部是变幻的迷宫，阿九多次走入死路，蛇灵少女在幻影中现身，为他指引方向。
少女告诉阿九，自己是被神药守护者封印的蛇灵，若想取药，需先解除她的封印。
阿九破解古代机关，找到封印核心，却发现启动机关需要献祭一段记忆。
少女的真实身份竟是千年前为救苍生而牺牲的药师，神药是她用生命炼成的。
阿九决定用自己的寿命换取妹妹的命，少女却牺牲自己成全他，蛇窟崩塌，阿九带着神药逃出。